DNA的提取與鑒定實(shí)驗(yàn)報(bào)告
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實(shí)驗(yàn)原理:
根據(jù)成熟雌蟾蜍體內(nèi)含大量卵細(xì)胞且可以方便獲取,細(xì)胞內(nèi)含核酸豐富,沒有其它組織器官等的干擾等優(yōu)點(diǎn)以確定蟾蜍卵細(xì)胞為實(shí)驗(yàn)所需的真核細(xì)胞。通過TRIZOL溶液中變性劑破碎真核細(xì)胞,然后經(jīng)過氯仿等有機(jī)溶劑抽提RNA,再利用RNA不溶于異丙醇的性質(zhì)將自身析出,達(dá)到分離提純的目的。
TRIzol的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的`蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。
甲基綠―吡羅紅為堿性染料,它分別能與細(xì)胞內(nèi)的DNA、RNA結(jié)合呈現(xiàn)不同顏色。當(dāng)甲基綠與吡羅紅作為混合染料時(shí),甲基綠與染色質(zhì)中DNA選擇性結(jié)合顯示綠色或藍(lán)色;吡羅紅與核仁、細(xì)胞質(zhì)中的RNA選擇性結(jié)合顯示紅色。其原因可能是兩種染料的混合染液中有競(jìng)爭(zhēng)作用,同時(shí)兩種核酸分子都是多聚體,而其聚合程度有所不同。甲基綠易與聚合程度高的DNA結(jié)合呈現(xiàn)綠色。而吡羅紅則與聚合程度較低的RNA結(jié)合呈現(xiàn)紅色(但解聚的DNA也能和派洛寧結(jié)合呈現(xiàn)紅色)。即RNA對(duì)派洛寧親和力大,被染成紅色,而DNA對(duì)甲基綠親和力大,被染成綠色。09419
實(shí)驗(yàn)材料:
。ㄒ唬┰噭
甲基綠―吡羅紅染料:①染色劑A液的兩種配制方法
第一種方法:取吡羅紅甲基綠粉1g,加入到100mL蒸餾水中溶解,然后用濾紙過濾,將濾液放入棕色瓶中備用。
第二種方法:取甲基綠2g溶于98mL蒸餾水中,取吡羅紅G5g溶于95mL蒸餾水中。取6mL甲基綠溶液和2mL吡羅紅溶液加入到16mL蒸餾水中,即為A液,放入棕色瓶中備用。(注意:用于核酸染色的是吡羅紅G,請(qǐng)不要錯(cuò)買吡羅紅B。)
、谌旧珓〣液的配制方法B液是一種緩沖液,由乙酸鈉和乙酸混合而成。先取乙酸鈉16.4g,用蒸餾水溶解至1000mL備用;再取乙酸12mL,用蒸餾水稀釋至1000mL備用。取配好的乙酸鈉溶液30mL和稀釋的乙酸20mL,加蒸餾水50mL,配成pH為4.8的B液(緩沖液)。
、廴旧珓┑呐渲迫旧珓┦怯葾液、B液混合配制而成的。取A液20mL和B液80mL混合,就是實(shí)驗(yàn)中所用的吡羅紅甲基綠染色劑。應(yīng)該注意的是該試劑應(yīng)現(xiàn)配現(xiàn)用。
2.TRIZOL試劑(Invitrogen公司購(gòu)買)
3.75%乙醇
4.氯仿
5.異丙醇
6.Nacl(0.14m/l)
。ǘ┢鞑
1.離心機(jī)(3000r.p.m)
2.冰浴
3.研缽
4.燒杯
5.量筒
6.試管
7.玻棒
8.膠頭滴管
9.離心管
10.天平
實(shí)驗(yàn)方法:
制備勻漿:
以班級(jí)為單位,稱取大概10g蟾蜍卵細(xì)胞(2~3℃保存),于研缽(可置于冰浴鍋上)中,根據(jù)10~30mg組織細(xì)胞加1mltrizol試劑的量加入其中,快速研磨,制備勻漿。實(shí)驗(yàn)二人合作為一組,每組取大概10ml勻漿。
RNA的提。
取回勻漿后,室溫靜置10min,使樣品充分裂解――離心(3000r.p.s)20mins――取上清液移至新的離心管――加1/5TRIZOL溶液體積氯仿――在手中反復(fù)振蕩搖勻,室溫靜置10min。――離心20mins――取上清液――在上清中加入等體積冰冷的異丙醇,室溫放置10min。――充分混勻,靜置10minute――離心20min――沉淀用75%乙醇洗滌兩次
定性試驗(yàn):
取2支干凈試管,一管加入1.5MLRNA溶液(將RNA顆粒狀的沉淀溶于
2ML0.14/NACL溶液中),另一管加入蒸餾水1.5ML,像兩管中加入3M甲基綠-吡羅紅染色劑,溶液變成紅色為陽(yáng)性反應(yīng)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
利用TRIZOL法可成功提取的RNA,并使得甲基綠-吡羅紅染色劑顯紅色。
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
TRIzol對(duì)人體有害,使用時(shí)應(yīng)戴一次性手套,注意防止濺出。
由于本科生實(shí)驗(yàn)室里的為普通離心機(jī),轉(zhuǎn)速不高,故可適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。
離心后,注意上清液和沉淀的取舍以及對(duì)RNA層的小心吸取,否則將導(dǎo)致RNA樣品中有DNA污染。
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