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生物醫(yī)學論文范文

時間:2023-04-27 14:42:30 生物醫(yī)學論文 我要投稿
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生物醫(yī)學論文范文

  [摘要]生物醫(yī)學是一門新興的學科,它是應用了生物學、醫(yī)學和生命科學的理論和方法而發(fā)展起來。隨著信息技術的高速發(fā)展,計算機科學已經深度參與和滲入到生物技術的研究之中了。生物醫(yī)學應用多屬于大規(guī)模計算密集型應用,而生物醫(yī)學研究中也越來越頻繁地涉及到大數(shù)據(jù)存儲和高性能集群運算需求技術,所以需要采用大規(guī)模的計算環(huán)境支持。

生物醫(yī)學論文范文

  [關鍵詞]生物醫(yī)學;計算平臺;管理模式;運行與維護

  近幾年,隨著生物醫(yī)學應用的飛速發(fā)展,大規(guī)模生物醫(yī)學應用計算平臺正從傳統(tǒng)的以計算集群為基礎的網(wǎng)格環(huán)境向高性能計算環(huán)境快速發(fā)展,以承載和支撐大規(guī)模生物與醫(yī)學為中心任務,充分利用其并行運算和大數(shù)據(jù)處理的能力,為大數(shù)據(jù)提供高效的處理和分析機制。

  一、生物醫(yī)學計算平臺的有效管理

 。ㄒ唬┥镉嬎闫脚_發(fā)揮的作用以及工作宗旨

  其作為相對獨立的輔助部門存在,為教學科研提供保障,最大限度地發(fā)揮資源的利用率,提供一流的生物醫(yī)學計算和存儲等服務工作。因此,計算平臺是否能夠按需求服務,科研和教學用戶對平臺服務是否滿意,如何通過創(chuàng)建和創(chuàng)新服務而為生物醫(yī)學研究創(chuàng)造更多的價值等一系列問題,依然是需要關注的重點問題。

 。ǘ┥镉嬎闫脚_所面臨的建設、運營等主要問題

  一方面,各實驗室和院所的發(fā)展對生物計算平臺的建設提出許多新的挑戰(zhàn),需要長遠目光和快速響應,比如每年的項目申報。另一方面,因頻繁變化的業(yè)務使計算平臺日常管理遭遇很多突發(fā)狀況,如臨時停電、軟硬件技術故障、突擊檢查等,要求提前做好充分的準備工作。

  (三)生物計算平臺服務管理的廣度和深度

  生物計算機平臺對人、基礎設施、信息資產、其他資產的管理,范圍廣,涉及到的面多,只有抓住信息這個要素以信息管理為重點,以流程為指標,建立標準服務級別,并進行模塊化管理。

 。ㄋ模┒ㄖ频姆⻊阵w系構架

  1)服務級別管理:計算機平臺的核心使命是為各類用戶提供滿意的存儲及計算服務,因此立足于平臺的實際,針對不同用戶的特點,制定和實施相匹配的用戶服務協(xié)議,是衡量平臺工作的核心標準之一。

  2)財務管理:計算機平臺逐年累月積累下來的教學和科研經驗,必須考慮投入和產出效益。因此,需要設計預算和計費管理、運維的管理、對外服務的管理等,費用約定應明確體現(xiàn)在服務協(xié)定上,這對改善計算平臺的運維和服務質量,提升平臺的使用平率都十分必要。

  3)持續(xù)可用性管理:作為一個重點建設,任務繁重的計算平臺,必須在人員、技術、資產等方面進行持續(xù)管理。并必須明確計算平臺服務需求,這樣平臺的工作目標才是明確的,這樣優(yōu)化和基礎構架才有實用性。

  4)事故能力的管理:為避免用戶違規(guī)、例外操作等造成的事故,計算機平臺需要制定嚴格的服務質量標準,并在此基礎上規(guī)范操作、記錄操作事故現(xiàn)象、分析并給出報告,以達到與用戶溝通、減少事故次數(shù)、提高服務質量的目的。計算平臺需要通過合理的崗位設置,來實現(xiàn)各類服務,并通過對人員的培訓,以及對資源的優(yōu)化合理配置,來發(fā)揮計算平臺投資的最大效能。

  5)問題配置管理:為兌現(xiàn)服務協(xié)議,降低事故損失,有必要開展事前分析,找出潛在因素,減少服務成本和對用戶的影響。而合理地配置是計算機平臺軟件協(xié)同、高效工作的基石,對系統(tǒng)的配置項需要定期確認,以確保變更管理和日志。

  6)變更發(fā)布管理:科學試驗的流程變更需要合理管理,因計算平臺面向的用戶眾多,擁有的信息資源有限,而在實際過程中,用戶的使用權限或端口會經常進行變更,所以用戶出于自身需要對軟硬件的變更也是變更管理工作的重點。為使IT技術信息透明化,應定期發(fā)布有關產品的配置項信息,而計算機平臺通常使用可信第三方提供的軟件產品。

  二、生物醫(yī)學計算平臺的合理化運維

  (一)生物醫(yī)學計算平臺下的用戶維度

  在傳統(tǒng)模式下,業(yè)務系統(tǒng)與物理服務器明確對應,而采用計算平臺后,是利用虛擬服務器進行服務的,其數(shù)量會動態(tài)增減。如要查看客戶滿意度、群集開機率、任務按時完成率以及平均等待時間,都可以在計算平臺中操作實施。因計算平臺面向的用戶面廣,所以用戶維度是關鍵。在為各類用戶提供滿意的計算平臺服務,并達到與客戶之間的良好溝通,才能對計算平臺的使用率以及良好的信譽有很大的提升。

 。ǘ┥镝t(yī)學計算平臺下科研項目與業(yè)績的維度

  隨著生物醫(yī)學計算平臺的發(fā)展,國家極度重視生物醫(yī)學,為該科學投入了大量的物力財力,鼓勵科研人員的積極參與,將計算平臺累積下來的寶貴科研資源進行研究、分析、整合。在預算成本的控制范圍內,科研工作者研究開發(fā)科研項目的同時,又為國家科研項目開源節(jié)流、控制成本,這對改善對外服務管理、項目成本以及完善計算平臺都起到了極大的促進作用,為國家在科研上的可持續(xù)發(fā)展打開了便利之門。

 。ㄈ┥镝t(yī)學計算平臺下建立面向客戶服務的虛擬化共享系統(tǒng)

  計算機平臺下,協(xié)助客戶運維管理部門實現(xiàn)從成本中心向價值中心的轉化,突出體現(xiàn)在計算平臺下科技價值體系的貢獻與重要性。國家在計算平臺下虛擬化的管理與技術還相對比較薄弱,所以這就要求在提高運維管理效率、降低運維資源投入的前提下,改善和提高計算平臺的運行模式,讓用戶在虛擬化的系統(tǒng)下,有權共享系統(tǒng)資源。虛擬化共享系統(tǒng)根據(jù)用戶可能需要的服務將進行分類,生成相應的虛擬機模板。系統(tǒng)自動會在用戶提出申請需要時,從存儲系統(tǒng)取出虛擬機模板,根據(jù)模板生成相應的虛擬機,并自動對其他所需資源進行配置,自動測定資源余量,然后提交到一個有資源余量的物理機上運行,最后給提出申請的用戶進行分配。

 。ㄋ模┥镝t(yī)學計算平臺下資源的優(yōu)化使用

  在醫(yī)院數(shù)據(jù)中心,提供的服務和很多業(yè)務系統(tǒng)的運行時間段不同,多數(shù)業(yè)務系統(tǒng)在白天的訪問量較大,晚上則相對較小。服務器在采購數(shù)據(jù)時,峰值是日常值的幾倍甚至幾十倍,這就導致大部分日常時間中服務器多數(shù)空閑,資源浪費嚴重。在計算機平臺下,虛擬服務與自動化服務相結合,可以使系統(tǒng)資源得到最優(yōu)化的使用,可設定各系統(tǒng)的服務時間段,在系統(tǒng)使用量較小的時候,減少該服務使用數(shù)據(jù)量、釋放其占用資源,將這些資源轉交給其他服務和系統(tǒng)。也可關閉不提供服務的服務器,以節(jié)省電力。

  三、結語

  為了有效提高管理與運維效果,在生物醫(yī)學計算平臺的管理實踐中,我們對其中的部分進行了因地制宜的修改、增減和實施,并在平臺內部進行了相對嚴格的標準化和文檔化記錄。而生物醫(yī)學計算平臺的管理與運維對促進我國的生物醫(yī)學技術,以及對現(xiàn)代化的可持續(xù)發(fā)展都有著積極的促進作用。

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