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5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)序列研究
為了探討幾種鱘魚免疫球蛋白(IgM)所包含的信息與其親緣和進化之間的關(guān)系, 分別對俄羅斯鱘(Acipenser. gueldenstaedtii)、小體鱘(A. ruthenus)、施氏鱘(A. schrenckii)、中華鱘(A. sinensis)和歐鰉(Huso huso)的IgM重鏈(IgH)恒定區(qū)進行了研究.采用RT-PCR的方法對IgH核酸序列進行了克隆, 通過軟件獲得了相應(yīng)的IgH氨基酸序列.在分別對這5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)4個區(qū)(CH1~CH4)進行研究后發(fā)現(xiàn), 其CH4區(qū)氨基酸序列相似性最高.通過對CH4區(qū)序列氨基酸變異期望值(Kaa), 物種分化時間(T)及物種間系統(tǒng)進化樹(Phylogenetic Tree)等參數(shù)的分析, 將克隆的5種鱘魚IgH恒定區(qū)序列與已發(fā)表的西伯利亞鱘同源序列比對(源于NCBI序列)后發(fā)現(xiàn): 西伯利亞鱘與俄羅斯鱘、施氏鱘與歐鰉、小體鱘各構(gòu)成一個分支, 并與中華鱘相對.實驗結(jié)果從體液免疫系統(tǒng)的演化這個角度, 反映了被研究的鱘魚物種間的分類地位、地理分布及進化關(guān)系之間的聯(lián)系.
作 者: 王荻 劉紅柏 WANG Di LIU Hong-Bai 作者單位: 王荻,WANG Di(中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所,哈爾濱,150070;東北林業(yè)大學(xué)野生動物資源學(xué)院,哈爾濱,150040)劉紅柏,LIU Hong-Bai(中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所,哈爾濱,150070;東北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士后流動站,哈爾濱,150030)
刊 名: 遺傳 ISTIC PKU 英文刊名: HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 2006 28(10) 分類號: Q95 關(guān)鍵詞: 免疫球蛋白 重鏈 恒定區(qū) 鱘魚 進化關(guān)系【5種鱘魚免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)序列研究】相關(guān)文章:
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