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參數(shù)序列比對算法研究
序列比對是生物信息學(xué)中的一項重要任務(wù),通過序列比對可以發(fā)現(xiàn)生物序列中的功能、結(jié)構(gòu)和進(jìn)化的信息.序列比對結(jié)果的生物學(xué)意義與所選擇的匹配、不匹配、插入和刪除以及空隙的罰分函數(shù)密切相關(guān).現(xiàn)介紹一種參數(shù)序列比對方法,該方法把最佳比對作為權(quán)值和罰分的函數(shù),可以系統(tǒng)地得到參數(shù)的選擇對最佳比對結(jié)果的影響.然后將其應(yīng)用于RNA序列比對,分析不同的參數(shù)選擇對序列比對結(jié)果的影響.最后指出參數(shù)序列比對算法的應(yīng)用以及未來的發(fā)展方向.
作 者: 張濤濤 郭茂祖 鄒權(quán) ZHANG Tao-tao GUO Mao-zu ZOU Quan 作者單位: 哈爾濱工業(yè)大學(xué)計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,哈爾濱,150001 刊 名: 生物信息學(xué) ISTIC 英文刊名: CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS 年,卷(期): 2008 6(2) 分類號: Q1 關(guān)鍵詞: 參數(shù)序列比對 多邊形分解 牛頓射線搜索算法 參數(shù)空間【參數(shù)序列比對算法研究】相關(guān)文章:
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