支持向量機及組合預測在蛋白質四級結構分類中的應用

目的:基于支持向量機建立一個自動化識別新肽鏈四級結構的方法,提高現(xiàn)有方法的識別精度.方法:改進4種已有的蛋白質一級序列特征值提取方法,采用線性和非線性組合預測方法建立一個有效的組合預測模型.結果:以同源二聚體及非同源二聚體為例.對4種特征值提取方法進行改進后其分類精度均提升了2～3%;進一步實施線性與非線性組合預測后,其分類精度再次提高了2～3%,使獨立測試集的分類精度達到了90%以上.結論:4種特征值提取方法均較好地反應出蛋白質一級序列包含四級結構信息,組合預測方法能有效地集多種特征值提取方法優(yōu)勢于一體.

作 者： 譚顯勝 袁哲明 周鐵軍 熊潔儀 王春娟 TAN Xian-shen YUAN Zhe-ming ZHOU Tie-jun XIO NG Jie-yi WANG Chun-juan   作者單位： 譚顯勝,TAN Xian-shen(湖南農業(yè)大學生物安全科學技術學院,湖南,長沙,410128;湖南農業(yè)大學理學院,湖南,長沙,410128)

袁哲明,熊潔儀,王春娟,YUAN Zhe-ming,XIO NG Jie-yi,WANG Chun-juan(湖南農業(yè)大學生物安全科學技術學院,湖南,長沙,410128)

周鐵軍,ZHOU Tie-jun(湖南農業(yè)大學理學院,湖南,長沙,410128) 

刊 名： 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展  ISTIC 英文刊名： PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE  年，卷(期)： 2008 8(4)  分類號： Q518-3  關鍵詞： 蛋白質四級結構   分類   支持向量機   組合預測  

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